Primary School di Tunas Muda School Kedoya menerapkan International Baccalaureate Primary Years Programme (PYP) yang fokus pada pengembangan potensi anak secara menyeluruh hingga Year 6. Siswa ditantang untuk berpikir kritis, aktif bertanya, serta berkolaborasi menyelesaikan masalah dalam berbagai proyek akademis yang kontekstual. Proses pembelajaran didukung oleh tenaga pendidik profesional yang berpengalaman serta fasilitas belajar interaktif untuk mendukung minat riset siswa sejak dini. Penanaman nilai spiritual Katolik menjadi fondasi utama dalam pembentukan karakter, mendidik siswa agar tumbuh menjadi pribadi yang berintegritas dan memiliki kepedulian sosial tinggi. Dengan lingkungan belajar yang suportif di kawasan Taman Kedoya Baru, siswa dipersiapkan dengan baik untuk siap melangkah ke jenjang pendidikan selanjutnya.