Middle School Pelita Harapan School Sentul City mendampingi siswa remaja melalui kerangka kerja IB Middle Years Programme (MYP) yang menekankan analisis kritis dan riset. Keunggulannya tecermin dari fasilitas pendukung kampus yang luas, pengembangan kepemimpinan, serta program asrama (boarding option) yang membina kemandirian siswa. Siswa didorong untuk memahami potensi diri dan siap berkontribusi positif bagi komunitas. Misi jenjang ini adalah mencetak remaja yang mandiri, berprinsip, dan tangguh secara akademis.